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Groupes de Travail

GT Gestion des données et Interopérabilité

Membres: Christian Barillot (Rennes, coordinateur) Bénédicte Batrancourt (Paris, coordinatrice) Frederic Cervenansky (Lyon) Jean-francois Chateil (Bordeaux) Mathieu Hatt (Brest) Damien Husson (Nancy) Julien Lamy (Strasbourg) Franck Michel (Nice) Eric Poiseau (Inria)

Objectif: Ce groupe de travail a pour objectif le stockage et la gestion des données de IAM à travers la mise en place d’une base de données distribuée permettant l’interopérabilité entre « sites » FLI identifiés (SHANOIR, CATI-DB et ARCHIMED). L’interopérabilité avec des entrepôts  cliniques locaux permettra  de faciliter l’utilisation de l’infrastructure pour les études de recherche clinique en imagerie. Les données seront dé identifiées et organisées de manière à ce que les chaines de traitement peuvent facilement être exécutées

GT Traitement des images et Workflows

Membres: Tristan Glatard (Lyon, coordinateur) Yann Cointepas (Neurospin) Olivier Commowick (Rennes) Olivier Coulon (Marseille) Mathieu Hatt (Brest) Michael Kain (Rennes) Marc Joliot (Bordeaux) Carole Lartizien (Lyon) Jean-Francois Mangin Johan Montagnat (Nice) Vincent Noblet (Illkirch) Dimitris Visvikis (Brest) Jan Warnking (Lyon) Objectif: L’objectif de ce groupe de travail et de développer pour IAM des services de développement et de  gestion de chaines de traitement d’images interopérables avec le système de gestion des données d’imagerie de l’infrastructure  L’enjeu est de pouvoir exécuter, en local ou déporté des séquences de traitement de données sur des installations de calcul haute performance (clusters, grilles ou nuages)..  L’objectif de ce travail consistera à permettre le test, l’adaptation et l’exécution de chaines de traitement d’images en se basant sur des technologies éprouvées et complémentaires disponibles au sein des équipes participantes (MedINRIA , BrainVisa et la plate-forme VIP.

GT3 : Imagerie Préclinique (petit animal en priorité)

Membres: Michel Dojat (coordinateur) F. Heitz (coordinateur)

Nicolas Costes Emmanuel Barbier (Grenoble) Franck Kober Thierry Detzescaux
Sébastien Meriaux
Jean-Paul Armaspach (Strasbourg)

Objectif L’objectif de ce groupe de travail est de développer une architecture logicielle orientée web pour la gestion des données cérébrales précliniques via l’extension de structures existantes pour l’imagerie clinique (CATI-PA, SHANOIR, MEDIBASE). Cela comprend:

  • Le développement d’un catalogue de logiciels et chaînes de traitement  dédiés au traitement de données du petit animal
  • La promotion de l’exploitation de cohortes dans les études précliniques.
  • A moyen terme, le nœud IAM se tournera vers des solutions industrielles sur base des spécifications reposant sur les démonstrateurs et les expérimentations réalisées.

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