Séances du jeudi matin de 10h à 12h (alternées entre ICJ, UMPA, Institut Fourier)
Programme prévisionnel 2025/2026 :
- 9 octobre 2025 , 10h-12h : UMPA (Lyon)
- vendredi 5 décembre 2025 : journée à Marseille
- 29 janvier 2026 10h-12h : Institut Fourier (Grenoble)
- vendredi 20 mars 2026 : journée à l’UMPA (Lyon)
- 2 avril 2026 10h-12h : ICJ (Lyon)
- 1 juin 2026 10h-16h : journée à Grenoble
2 avril 2026 de 10h à 12h, ICJ, Université Lyon 1, Villeurbanne.
- Andrea Ducos (Equipe Inria Aïstrosight) : Introduction aux méthodes de découverte d’équation et utilisation dans un contexte biologique
- Maha Reda (École des Mines de Saint-Étienne, Sainbiose, STBio) : Modélisation des flux lymphatiques et veineux dans le membre inférieur : applications au lymphœdème et à la compression thérapeutique
- Abstract: Les astrocytes sont des cellules gliales du système nerveux central, connectées à des milliers de structures neuronales. Longtemps considérées comme des cellules de soutien, des études récentes ont révélé qu’elles jouent un rôle actif dans la transmission du signal mais restent encore largement incompris. Je m’intéresse en particulier au signal calcique astrocytaire, dont une grande partie se produit dans des prolongements trop fins pour être visualisés avec les microscopes actuels, ce qui rend la modélisation nécessaire.
Ma thèse adopte une approche basée sur les données : plutôt que de partir d’hypothèses sur les mécanismes biologiques sous-jacents, nous cherchons à découvrir directement une EDP gouvernant la dynamique calcique à partir du signal lui-même en utilisant des méthodes de découverte d’équation. L’objectif est d’obtenir des équations interprétables permettant de mieux comprendre les dynamiques calciques.
Dans cette présentation, je commencerai par introduire les méthodes de découverte d’équations et dresser un état de l’art de ce domaine. Je présenterai ensuite un benchmark de cinq de ces méthodes, puis les expériences que nous avons menées avec la méthode WSINDy sur des données simulées.
Ces travaux constituent une première étape vers l’application de ces méthodes à des données biologiques réelles, avec pour objectif à terme de mieux comprendre l’impact de pathologies sur les signaux calciques.
- Abstract: Le lymphoedème est une maladie caractérisée par un déséquilibre dans le drainage lymphatique, entraînant une accumulation de fluide interstitiel dans les membres inférieurs, un gonflement et un remodelage des tissus. Les bas de compression sont utilisés comme traitement principal pour réduire le gonflement et améliorer le drainage du fluide. Dans un premier axe, nous avons développé un modèle numérique poroélastique 3D patient-spécifique permettant de simuler le drainage du fluide interstitiel et la déformation des tissus dans le membre inférieur sous différentes stratégies et niveaux de compression. Ce modèle intègre les échanges entre capillaires sanguins et lymphatiques, ainsi que les effets de la gravité, de la perméabilité et de la compression externe sur la distribution de la pression du fluide interstitiel. Dans un second axe, nous avons développé un modèle 1D du réseau veineux du membre inférieur, incluant la dynamique des valves, les effets de la gravité et de la compression externe. Ce modèle permet d’étudier le retour veineux et d’évaluer l’impact de la compression sur les profils de pression et de débit. Ces deux approches complémentaires ouvrent la voie à une modélisation multi-échelle, reliant la dynamique du fluide interstitiel dans le tissu aux mécanismes vasculaires .