La rétine humaine ou animale s’étudie “in vivo” en mesurant à l’aide d’un tableau
d’électrodes les potentiel d’actions générés par une population de neurones qui réagit à un stimulus donné. Sur chaque électrode est mesuré un voltage qui reflète le mélange des réponses de plusieurs neurones. C’est un défi de pouvoir identifier puis trier les événements correspondants aux réponses de chaque neurone. Nous venons de publier un algorithme réalisant ce tri. Il est proposé ici de reprendre cet algorithme et d’en faire un logiciel performant et utilisable par des biologistes.
L’algorithme devra être parallélisé sur les processeurs graphiques de l’ordinateur qui exécute le
calcul, pour obtenir un temps d’exécution compatible avec une séance d’expérimentation biologique.
Un contrat de six mois de conception et développement logiciel est proposé ici pour mener à bien ce projet.
https://project.inria.fr/keops/files/2012/11/CDD-online-spikesorting.pdf
