2026
Conference papers
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- titre
- 3T MRI 4D flow sequence acquisition time reduction on a vascular phantom
- auteur
- Esther Fontaine, Nicolas Passat, Stéphanie Salmon, Antoine Mendes-Carreira, Christophe Portefaix
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2026, London, United Kingdom
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Poster communications
- titre
- Quantitative Analysis of X-ray angiography images in Acute Ischemic Stroke
- auteur
- Insaf Mellakh, Erwan Kerrien, Julien Oster
- article
- IABM 2026 – Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale, Mar 2026, Lyon, France. , 2026
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- titre
- A real-world patient MR Angiography (MRA) Database for Brain Vasculature Segmentation and Modelling in Predictive Simulation for the Planning of Interventional Neuroradiology procedures (PreSPIN)
- auteur
- Bailiang Chen, Odyssée Merveille, Emilien Micard, François Zhu, Ulysse Puel, Pierre Rougé, Antoine Kneib, Nicolas Passat, Guillaume Dollé, Benjamin Gory, Erwan Kerrien, Marine Beaumont
- article
- Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), Mar 2026, Lyon, France
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2025
Journal articles
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- titre
- VSMOD: A Vessel Segmentation and MODelization plugin for 3D Slicer
- auteur
- Morgane des Ligneris, Gabriel Husak, Azéline Aillet, Guillaume Dollé, Carole Frindel, Odyssée Merveille
- article
- Journal of Open Source Software, 2025, 10 (114), pp.8563. ⟨10.21105/joss.08563⟩
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- titre
- Quasi-Static Cosserat Rods in Contact with Implicit Surfaces
- auteur
- Radhouane Jilani, Pierre-Frédéric Villard, Erwan Kerrien
- article
- IEEE Robotics and Automation Letters, 2025, 10 (7), pp.6536-6543. ⟨10.1109/LRA.2025.3570131⟩
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- titre
- Multivalued component tree: New results and a bridge between partial and total partition trees
- auteur
- Nicolas Passat, Romain Perrin, Jimmy Francky Randrianasoa, Camille Kurtz, Benoît Naegel
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2025, 67 (6), pp.57. ⟨10.1007/s10851-025-01264-8⟩
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- titre
- Consistent connected operators based on trees of shapes
- auteur
- Julien Mendes Forte, Nicolas Passat, Akinobu Shimizu, Yukiko Kenmochi
- article
- SIAM Journal on Imaging Sciences, 2025, 18 (4), pp.2547-2579. ⟨10.1137/25M174704X⟩
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- titre
- Guidelines for cerebrovascular segmentation: Managing imperfect annotations in the context of semi-supervised learning
- auteur
- Pierre Rougé, Pierre-Henri Conze, Nicolas Passat, Odyssée Merveille
- article
- Computerized Medical Imaging and Graphics, 2025, 119, pp.102474. ⟨10.1016/j.compmedimag.2024.102474⟩
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Conference papers
- titre
- Hemodynamic Modeling of Cerebral Aneurysms: Coupling 4D Flow MRI and Finite Element Simulations
- auteur
- Esther Fontaine, Guillaume Dollé, Nicolas Passat, Stéphanie Salmon, Christophe Portefaix
- article
- FreeFEM Days, Laboratoire Jacques-Louis Lions (LJLL), Sorbonne Université, Dec 2025, Paris, France
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-
- titre
- A real-world patient MR angiography (MRA) database for brain vasculature segmentation and modelling in predictive simulation for the planning of interventional neuroradiology procedures (PreSPIN)
- auteur
- Bailiang Chen, Odyssée Merveille, Emilien Micard, François Zhu, Ulysse Puel, P. Rougé, Nicolas Passat, Benjamin Gory, Erwan Kerrien, Marine Beaumont
- article
- ESMRMB 2025 Online 41st Annual Scientific Meeting 8–11 October 2025, The European Society for Magnetic Resonance in Medicine and Biology, Oct 2025, Marseille, France. ⟨10.1007/s10334-025-01278-8⟩
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- titre
- Optimisation du temps d’acquisition de la séquence de flux 4D en IRM 3T pour l’imagerie de vaisseaux cérébraux
- auteur
- Esther Fontaine, Nicolas Passat, Stéphanie Salmon, Christophe Portefaix
- article
- Journée thématique Imagerie vasculaire (GdR IASIS), 2025, Paris, France
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- titre
- Arbres morphologiques de partitions partielles : tutoriel, avancées, perspectives
- auteur
- Nicolas Passat
- article
- Journées du Groupe de Travail en Géométrie Discrète et Morphologie Mathématique (GDMM), 2025, Chambéry, France
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- titre
- Comparaison d’une séquence IRM de flux 4D et de la simulation numérique pour l’étude hémodynamique des anévrismes intracrâniens
- auteur
- Esther Fontaine, Stéphanie Salmon, Guillaume Dollé, Nicolas Passat, Christophe Portefaix
- article
- Congrès de la Société de Mathématiques Appliquées et Industrielles (SMAI), Société des Mathématiques Appliquées et Industrielles, 2025, Carcans Maubuisson, France
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-
- titre
- Tutorial – Topological image analysis based on morphological hierarchies
- auteur
- Yukiko Kenmochi, Jean Cousty, Nicolas Passat
- article
- International Conference on Discrete Geometry and Mathematical Morphology (DGMM), 2025, Groningen, Netherlands
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Poster communications
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- titre
- ccDice : un score de Dice topologique basé sur les composantes connexes
- auteur
- Pierre Rougé, Odyssée Merveille, Nicolas Passat
- article
- Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), 2025, Nice, France
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-
Theses
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- titre
- Simulation of Intravascular Catheter Navigation Using Cosserat Rod Theory
- auteur
- Radhouane Jilani
- article
- Computer Science [cs]. Université de Lorraine, 2025. English. ⟨NNT : 2025LORR0105⟩
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2024
Journal articles
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- titre
- Topology aware multitask cascaded U-Net for cerebrovascular segmentation
- auteur
- Pierre Rougé, Nicolas Passat, Odyssée Merveille
- article
- PLoS ONE, 2024, 19 (12), pp.e0311439. ⟨10.1371/journal.pone.0311439⟩
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Conference papers
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- titre
- Solving Dynamic Cosserat Rods with Frictional Contact Using the Shooting Method and Implicit Surfaces
- auteur
- Radhouane Jilani, Pierre-Frédéric Villard, Erwan Kerrien
- article
- International Conference on Intelligent Robots and Systems (IROS), IEEE, Oct 2024, Abu Dhabi, United Arab Emirates. ⟨10.1109/IROS58592.2024.10801774⟩
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-
- titre
- Angular Strain Parameterization for Solving Static Cosserat Rods
- auteur
- Radhouane Jilani, Pierre-Frédéric Villard, Erwan Kerrien
- article
- ICRA@40, IEEE, Sep 2024, Rotterdam, Netherlands
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- titre
- How to modify the tree of shapes of an image: Connected operators without gradient inversion
- auteur
- Julien Mendes Forte, Nicolas Passat, Yukiko Kenmochi
- article
- Reconnaissance des Formes, Image, Apprentissage et Perception (RFIAP), Association française pour la reconnaissance et l’interprétation des formes, Jul 2024, Lille, France
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-
- titre
- New algorithms for multivalued component-trees
- auteur
- Nicolas Passat, Romain Perrin, Jimmy Francky Randrianasoa, Camille Kurtz, Benoît Naegel
- article
- International Conference on Pattern Recognition (ICPR), 2024, Kolkata, India. pp.19-35, ⟨10.1007/978-3-031-78347-0_2⟩
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- titre
- ccDice: A topology-aware Dice score based on connected components
- auteur
- Pierre Rougé, Odyssée Merveille, Nicolas Passat
- article
- Workshop on Topology- and Graph-Informed Imaging Informatics (TGI3@MICCAI), 2024, Marrakesh, Morocco. pp.11-21, ⟨10.1007/978-3-031-73967-5_2⟩
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- titre
- How to modify the tree of shapes of an image: Connected operators without gradient inversion
- auteur
- Julien Mendes Forte, Nicolas Passat, Yukiko Kenmochi
- article
- Conference Geometry & Computing / Journées du Groupe de Travail en Géométrie Discrète et Morphologie Mathématique (GDMM), 2024, Luminy, France
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- titre
- How to modify the tree of shapes of an image: Connected operators without gradient inversion
- auteur
- Julien Mendes Forte, Nicolas Passat, Yukiko Kenmochi
- article
- International Conference on Pattern Recognition (ICPR), 2024, Kolkata, India. pp.1-18, ⟨10.1007/978-3-031-78347-0_1⟩
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Poster communications
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- titre
- A pipeline from MRI 4D Flow sequence to numerical simulation
- auteur
- Esther Fontaine, Stéphanie Salmon, Nicolas Passat, Christophe Portefaix
- article
- Journée Rémoise des Jeunes Chercheurs en Santé (JRJCS), Oct 2024, Reims, France
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- A pipeline from MRI 4D Flow sequence to numerical simulation
- auteur
- Esther Fontaine, Stéphanie Salmon, Nicolas Passat, Christophe Portefaix
- article
- European Society for Magnetic Resonance in Medicine and Biology Annual Scientific Meeting (ESMRMB), Oct 2024, Barcelona, Spain
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- titre
- How to modify the tree of shapes of an image: Connected operators without gradient inversion
- auteur
- Julien Mendes Forte, Nicolas Passat, Yukiko Kenmochi
- article
- International Conference on Discrete Geometry and Mathematical Morphology (DGMM), Apr 2024, Florence, Italy
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-
- titre
- Guidelines for Cerebrovascular Segmentation: Managing Imperfect Annotations in the context of Semi-Supervised Learning
- auteur
- Pierre Rougé, Nicolas Passat, Odyssée Merveille
- article
- Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), Mar 2024, Grenoble, France
- Accès au texte intégral et bibtex
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-
- titre
- New algorithms for multivalued component trees
- auteur
- Nicolas Passat, Romain Perrin, Jimmy Francky Randrianasoa, Camille Kurtz, Benoît Naegel
- article
- Reconnaissance des Formes, Image, Apprentissage et Perception (RFIAP), 2024, Lille, France.
- Accès au texte intégral et bibtex
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2023
Journal articles
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- titre
- Modeling and hexahedral meshing of cerebral arterial networks from centerlines
- auteur
- Méghane Decroocq, Carole Frindel, Pierre Rougé, Makoto Ohta, Guillaume Lavoué
- article
- Medical Image Analysis, 2023, 89, pp.102912. ⟨10.1016/j.media.2023.102912⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- OpenCCO: An Implementation of Constrained Constructive Optimization for Generating 2D and 3D Vascular Trees
- auteur
- Bertrand Kerautret, Phuc Ngo, Nicolas Passat, Hugues Talbot, Clara Jaquet
- article
- Image Processing On Line, 2023, 13, pp.258-279. ⟨10.5201/ipol.2023.477⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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Conference papers
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- titre
- An Orthogonal Collocation Method for Static and Dynamic Cosserat Rods
- auteur
- Radhouane Jilani, Pierre-Frédéric Villard, Erwan Kerrien
- article
- International Conference on Intelligent Robots and Systems (IROS), IEEE, Oct 2023, Detroit, United States. ⟨10.1109/IROS55552.2023.10341631⟩
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- titre
- U-Net en cascade utilisant le clDice pour la segmentation de réseaux vasculaires
- auteur
- Pierre Rougé
- article
- ORASIS, 2023, Carqueirane, France
- Accès au bibtex
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Poster communications
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- titre
- U-Net en cascade utilisant une fonction de perte topologique pour la segmentation du réseau vasculaire cérébral
- auteur
- Pierre Rougé, Nicolas Passat, Odyssée Merveille
- article
- Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM), 2023, Paris, France
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Introduction à l’utilisation de l’IRM 4D de flux pour la prédiction de l’évolution des anévrismes intra-crâniens
- auteur
- Esther Fontaine, Christophe Portefaix, Stéphanie Salmon
- article
- Journée Rémoise des Jeunes Chercheurs en Santé (JRJCS), 2023, Reims, France
- Accès au texte intégral et bibtex
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2022
Journal articles
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- titre
- A Benchmark Framework for Multiregion Analysis of Vesselness Filters
- auteur
- Jonas Lamy, Odyssee Merveille, Bertrand Kerautret, Nicolas Passat
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2022, 41 (12), pp.3649-3662. ⟨10.1109/TMI.2022.3192679⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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Conference papers
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- titre
- A Software to Visualize, Edit, Model and Mesh Vascular Networks
- auteur
- Méghane Decroocq, Guillaume Lavoué, Makoto Ohta, Carole Frindel
- article
- 2022 44th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), Jul 2022, Glasgow, United Kingdom. ⟨10.1109/EMBC48229.2022.9871365⟩
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- titre
- Adaptive homotopy for organ segmentation
- auteur
- Nicolas Passat
- article
- Computer Assisted Radiology and Surgery (CARS), 2022, Tokyo, Japan
- Accès au bibtex
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Poster communications
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- titre
- Réseau de neurones multitâche centré sur la topologie pour la segmentation du réseau vasculaire cérébral
- auteur
- Pierre Rougé, Odyssée Merveille, Nicolas Passat
- article
- Journée Rémoise des Jeunes Chercheurs en Santé (JRJCS), Oct 2022, Reims, France
- Accès au texte intégral et bibtex
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2020
Conference papers
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- titre
- Meshing Arterial Networks From Manually Extracted Centerlines
- auteur
- Méghane Decroocq, Carole Frindel, Makoto Ohta, Guillaume Lavoué
- article
- International Conference on Flow Dynamics (ICFD 2020), Oct 2020, Sendai, Japan
- Accès au texte intégral et bibtex
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